一是专家配置不削弱。东港院区和沈家门院区各学科专家门诊、专科门诊按照1:1比例设置，原则上高级职称专家在东港院区和沈家门院区各安排坐诊一次。
二是门诊科室设置不削弱。沈家门院区设立各类专家专科门诊、普通门诊、夜间门诊，中西医内、外、妇、儿等科室，门急诊齐全，同时还将设立中医名医馆，中医养生、老年病、康复、针灸、推拿门诊。
三是急诊力量不削弱，东港院区投入使用后，舟山市120急救中心普陀急救站同时搬迁至东港院区，但在沈家门院区继续保留“120”急救点，缩小沈家门城区急救服务半径，缓解急救需求的压力。
四是设备设施配备不削弱。医院根据学科建设需求合理配置两院区设备，东港院区配备1.5T核磁共振、16排螺旋CT、DR等高端医疗设备，沈家门院区继续保留螺旋CT、 DR、 CR、彩超等基础医疗设备，达到县级医院标准。
五是信息化实行共享。院区之间实行无缝对接，所有就诊者的信息互通共享，病人检查的CT等影像资料和化验等数据完全互通，可进行在线相互会诊，实现了区域内的数字化和一体化。
